В отделении гастроэнтерологии оказывается помощь детям с гастроэнтерологической патологией: хронические гастриты и гастродуодениты, неспецифический язвенный колит, целиакия, цирроз печени, хронические гепатиты, наследственные заболевания ЖКТ, рецидивирующие язвенные болезни желудка и 12-перстной кишки и др. Всем пациентам проводят необходимые исследования: общеклинические, ультразвуковые, эндоскопические, рентгенологические. В комплексном лечении используются современные лекарственные средства.