Эндоскопическое отделение оснащено современными эндоскопами ведущих стран мира. В отделении работает высококвалифицированный медицинский персонал. Помимо диагностических исследований желудочно-кишечного тракта и трахеобронхиального дерева, сотрудниками отделения производится эндоскопическое лечение кровоточащих язв, лечение ожирения путем постановки внутрижелудочного баллона.