Отделение эндоскопии ГБУЗ ЧОКБ является одним из крупнейших на территории Российской Федерации. Кабинеты оборудованы самыми современным видеоэндоскопическими аппаратами, оснащенными дополнительными опциями для детализации изображения и возможностью фотозаписи. Колоноскопии выполняются с использованием углекислого газа для минимизации неприятных ощущений во время и после процедуры.