"Городская клиническая больница №2" в Челябинске имеет широкий спектр отделений и специализированных служб. В составе больницы функционирует диагностическое отделение, где проводятся различные виды исследований, включая гастроскопию и колоноскопию, позволяющие детально оценить состояние желудочно-кишечного тракта.
Среди других ключевых отделений — детское городское травматолого-ортопедическое отделение, женская консультация и женская консультация поликлиники №1, клинико-диагностическая лаборатория. Также в больнице работают отделения аллергологии и иммунопрофилактики, амбулаторной психотерапевтической и неврологической помощи, профилактики, офтальмологии с фокусом на патологии рефракции и лазерной хирургии глаза, а также рентгеновское и стоматологическое отделения.