Эндоскопическое отделение обслуживает стационар и поликлинику ОДКБ, а также оказывает консультативную помощь больным из районов области и города Ульяновска. Наряду с диагностическими исследованиями в отделении широко проводятся и лечебные мероприятия: удаление инородных тел ЖКТ, трахеи и бронхов, эндоскопическое бужирование стенозов пищевода, эндоскопическое удаление новообразований ЖКТ, склеротерапия варикозно расширенных вен пищевода, эндоскопический гемостаз при кровотечениях.